Small RNA测序

（1）简介

Small RNA：又称为小RNA，包括microRNA，siRNA，piRNA三类，属于非编码RNA。Small RNA测序一般收集样本中18-40nt的片段进行测序分析，研究特定组织在特定状态下的所有已知smallRNA，也可以发现新的smallRNA并预测其靶基因。

（2）应用领域

l                      细胞分化和发育研究

l                      调控机理研究

l                      疾病标志物查找

l                      疾病分子诊断

l                      基因药物研发

（3）技术路线

（4）技术参数

1）样本要求

新鲜动物组织：≥0.5g

新鲜培养细胞：≥1×107个

新采集的全血：≥8ml

PAXgene 采血管：≥3管

RNA要求：

样品浓度：≥100 ng/ul

样品体积：>10ul

样品总量：>3ug

样品纯度：RIN≧6.8 (动物)、6（植物、真菌），OD260/280≧1.8，OD260/OD230≧1

2）测序策略：SE50

3）推荐数据量：10M

4）测序平台：Novaseq

（5）参考文献
Wang Yanbo,Chen Zhang-Peng,Hu Huanhuan et al. Sperm microRNAs confer depression susceptibility to offspring.[J] .Sci Adv, 2021, 7: undefined.