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RACE技术服务

(1)实验介绍

RACE(rapid-amplification of cDNA ends)是通过PCR进行cDNA末端快速克隆的技术。本公司可对有polyA尾和5’帽子结构的真核生物mRNA进行相应的RACE分析。进行RACE实验需至少有200bp以上的已知序列。

3’RACE原理:用带有特殊接头的逆转录引物对总RNA进行逆转录,根据逆转录引物上的接头序列和mRNA已知序列设计引物即可扩增出3’末端序列。

5’RACE原理:将5’末端的帽子结构去掉后,mRNA5’末端即暴露出磷酸基团。用T4 RNA连接酶在mRNA5’末端连接特异性接头。反转录后,根据接头序列和mRNA已知序列设计引物对反转录产物扩增,即可扩增出mRNA5’末端的序列。

cDNA末端快速扩增技术 (rapid amplification of cDNA ends, RACE),是运用PCR技术,在仅知目标基因部分序列片段的基础上,从转录本中快速扩增其cDNA的5’和3’末端的有效方法。主要应用于全长基因获取、转录起始位点的位置、转录调控区域、miRNA/lncRNA靶标验证。

(2)服务流程:

3‘RACE实验

根据已知序列设计带接头的逆转录引物及巢式PCR引物

高质量RNA提取

用带接头的逆转录对mRNA进行逆转录

槽式PCR扩增3’末端序列,并电泳检测

将PCR产物送测序公司测序或连接T载体后测序

5‘RACE实验

根据已知序列设计巢式PCR引物

高质量RNA提取

去磷酸化处理

“去帽子”反应

5’RACE Adaptor的连接

逆转录反应

巢式PCR扩增5’末端序列

将PCR产物送测序公司测序或连接T载体后测序

(3)样本要求

1)需提供新鲜组织或活细胞样本。如果提供RNA样本,需要高质量无降解RNA片段。

2)组织或RNA样本需干冰或液氮运输。细胞样本常温运输。

3)需提供至少200bp已知序列,且已知序列需与mRNA序列一致,不能是与mRNA互补序列,否则RACE实验可能无法完成。

(4)其他

关键因素:RACE实验成功的关键在于高质量与完整性好的RNA以及特异性强的引物,我们有专业的技术员能够完成以上的任务。

交付结果:扩增全长片段测序报告;扩增的全长片段的电泳图;含全长片段的质粒及菌液。

交付时间:大约15-25个工作日


分子生物学实验